Почему так - в софтверных конторах, обычно, вопрос управления проектами как-то решен. Хотя, есть исключения - как-то работал фрилансером с конторкой на 5 человек, которая живет с продажи своей единственной программы, но ни багтрекера, ни системы контроля версий за 5 лет развития так и не завели...
Не будем о грустном ;) Итак, багтрекеры, которыми мне приходилось пользоваться:
- Redmine
- Trac
- Mantis
- Atlassian JIRA
- какой-то ужастик на датском ;) и парочкой других "ноунеймов" ;)